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为加速新冠病毒药物研发,BAT滴滴向科研机构免费开放AI算力

发布于:2024-06-18 编辑:匿名 来源:网络

随着中国疾控中心成功分离出新冠病毒,人们对新冠病毒的认识也越来越深入病毒,以及相关疫苗和特效药物的研发也在紧锣密鼓地进行中。

然而这个过程需要大量的数据分析、文献筛选和超级计算的支持。

为了进一步加快新疫苗、新药物的研发和上市,国内多家科技公司向科研机构免费开放AI算力。

1月29日晚,阿里云宣布疫情期间向全球公共科研机构免费开放AI的全部算力。

阿里云高性能计算团队负责人何万青解释道:一般来说,一款药物的研发需要病毒毒株的分离、测序分析、病毒靶点的识别和验证、寻找相应的化合物、评价研究和动物实验、制剂合成等步骤。

、临床试验和营销。

总而言之,药物研发过程需要大量的资金、人力和时间投入。

据了解,美国一款新药的研发平均需要10-15年,从研发项目启动到最终获得FDA(食品药品监督管理局)批准,花费超过13年100年。

万美元。

雷锋网注:研究人员正在对新型冠状病毒进行毒株分离。

目前,新冠病毒疫苗和特效药物的研发已完成毒株分离和基因测序。

这部分工作主要在实验室进行;而后续的研发,包括病毒靶点的识别和验证、寻找相应的化合物等,都需要借助云计算。

何万青对媒体表示:尤其是在寻找相应的化合物时,必须使用超大规模的计算能力,因为可以制成药物的化合物有0种。

需要先从复杂的化合物中找到针对病毒合适的“攻击方向”,然后进行合成、拼接。

如果必须在实验室里一一进行比较,那就太浪费时间了。

此次阿里云开放AI算力后,全球公共科研机构无需“排队”,可以在随时弹性伸缩、数据交换和发布更加便捷的协作环境中工作。

此外,AI的计算能力在筛选医学文献、分析历史数据时也能派上用场。

此前类似SARS等疫情爆发后,医学界留下了大量历史药物研发和临床数据,以及散落在世界各地的许多医学文献,这可能成为治疗这种新型冠状病毒的突破口。

1月30日,腾讯正式宣布免费提供超级计算能力、计算集群支持和基础云计算能力;同时成立了应急工作组,帮助加快疫苗研发和新药筛选。

上述两个团队在腾讯提供的算力支持下,正在开展针对COVID-19的药物筛选和病毒突变预测工作。

此前,国家科技部紧急启动相关应急攻关项目。

中山大学药学院罗海滨教授团队入选“新型冠状病毒保护性抗体、疫苗及药物筛选与评价研究”项目,负责筛选具有治疗效果的候选药物。

毒品等工作。

为此,腾讯云迅速调度了一批GPU服务器节点,并为罗教授团队开通了高性能计算账户,免费提供全部计算资源,支持罗教授团队针对新型冠状病毒的药物筛选和病毒变异预测。

与此同时,北京生命科学研究院/清华大学生物医学交叉研究院黄牛教授实验室正在推进基于新冠病毒靶点结构的化合物虚拟筛选。

腾讯提供了大量标准CPU计算能力和对象存储能力,帮助黄牛教授实验室完成基于结构的药物分子设计的离线计算任务。

针对新型冠状病毒的多靶点,黄牛教授实验室利用腾讯云秒级交付的海量高性能计算和存储资源,快速计算筛选上亿个化合物数据库,结合实验验证,找到新结构类型化合物的先导,为下一步新药研发提供基础。

总而言之,腾讯云强大的CPU和GPU算力调度能力可以为基因测序和医学工程提供稳定高效的算力支持,从而降低创新药物早期研发的成本和周期。

百度紧随阿里巴巴和腾讯的脚步。

百度研究院还于2020年1月30日宣布,将线性时间算法LinearFold以及全球最快的现有技术向全球基因检测机构、防疫中心和科研中心免费开放。

RNA结构预测网站,提高新型冠状病毒RNA空间结构预测速度,助力疫情防控。

具体来说,2020年7月,百度首次提出LinearFold算法,使得预测整个序列和基因组的RNA结构成为可能。

这也是RNA结构预测领域的重大突破。

此次引起武汉肺炎的新型冠状病毒与SARS病毒、艾滋病毒、埃博拉病毒、流感病毒一样,都是RNA病毒。

其单链结构使得病毒更容易发生变异,使得疫苗的研发变得困难。

但如果医学专家能够更快、更深入地了解COVID-19基因组的本质,这将为靶向药物的设计和开发提供重要信息。

为加速新冠病毒药物研发,BAT滴滴向科研机构免费开放AI算力

传统上,RNA 二级结构预测需要具有三次时间复杂度的算法。

例如,将序列长度加倍需要 8 倍的计算时间。

非常长的序列,例如RNA病毒基因组(例如,HIV大约有10,000个碱基,埃博拉病毒大约有20,000个碱基)。

)需要很长的等待时间。

冠状病毒(包括SARS病毒和这次新型冠状病毒)的基因组是所有RNA病毒中最长的,长达3万个碱基,最快的经典算法也需要55分钟。

不过,通过百度的LinearFold算法,这个计算时间被压缩到了27秒,相当于提升了30%。

同时,百度还向全球科学家免费开放其RNA结构预测网站。

这些将提高基因检测、疫苗研发等科研中心的工作效率,迅速提高病毒研究和疫苗研发的速度。

值得一提的是,此前,百度还宣布设立总规模3亿元的疫情和公共卫生安全专项基金,用于支持治疗药物筛选、研发等一系列抗疫工作。

针对新型冠状病毒肺炎等新疾病。

滴滴云雷锋注:图片来自滴滴云。

2020年2月1日,滴滴云也加入了BAT的行列——滴滴云宣布,在共同确保服务正常的基础上,将成立紧急抗疫团队并提供免费服务。

向国内科研机构、医疗救援平台等开放抗疫相关工作的GPU云计算资源和技术支持,包括但不限于GPU云服务器、负载均衡SLB、弹性公网EIP等及相关技术支持服务。

据雷锋网了解,疫情期间,国内凡是专注于该领域研究和药物开发的公立科研机构、医院、学校、在线医疗平台、免费教育资源提供者、防疫资源援助等相关平台,新冠病毒可以申请。

联系滴滴云。

滴滴云表示将尽快全力配合,提供资源和技术支持,为打赢疫情防控阻击战贡献力量。

为加速新冠病毒药物研发,BAT滴滴向科研机构免费开放AI算力

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