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新冠病毒的变异被误解了， S亚型实际上是L亚型的“祖先”吗？

发布于：2024-06-17 编辑：匿名来源：网络

不可否认的事实是，新冠病毒仍在朝着我们未知的方向变化。

面对比SARS病毒更好的新冠病毒，科研人员最担心的事情还是来了。

据雷锋网消息，3月3日，中国科学院主办的《国家科学评论（ National Science Review ）》发表了一篇题为《关于 SARS-CoV-2 的起源和持续进化（ On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2）》的论文。

论文对新冠病毒全基因组进行了迄今为止最大规模的分子进化分析，发现该病毒株发生了突变点，其中3个可分为L和S两个亚型。

S型是较旧的版本，而L亚型更具攻击性和传染性。

从比例来看，L亚型较为常见，达到70%，S亚型占30%。

对此，不少网友也表示担忧：“我怀疑这个病毒有智商”。

新型冠状病毒可能分为两种类型。

这不是最近发生的突变。

值得注意的是，今日中午，据界面新闻报道，行业媒体BioArt团队对相关科研团队的研究进行分析后表示：有媒体称“新冠病毒已发生变异”。

这是一个误解。

正确的理解应该是：新冠病毒根据基因组突变位点的不同，可分为L型和S型两种。

然而，这两种突变类型可能在病毒爆发的早期就已经存在，而不是由最近的突变引起的。

发生什么了？这恐怕要追溯到论文本身。

S亚型是L亚型的“祖先”，没有重组吗？雷锋网获悉，本次研究共选取了2个病毒基因组序列，发现该病毒株发生了3个突变点，其中同义突变（同义突变）43个，错义突变（非同义突变）83个， 70%的病毒序列有7个相同的有义突变，加上1个相同的错义突变（L84S），从而影响了6种病毒蛋白的功能。

新冠病毒毒株衍生突变谱分析，橙色代表非同义突变，绿色代表同义突变（图片来源论文）该研究将这70%具有这些突变的病毒归类为SARS-CoV-2亚型的L（L）源自错义突变L84S)； S84L称为S亚型。

论文作者认为，基于新冠病毒的进化，L和S亚型之间的传播力和疾病严重程度可能存在重大差异。

为了进一步研究L型和S型毒株之间的关系，研究人员根据SARS-CoV-2病毒的全基因组序列重建了它们的系统发育树（phylogenesis tree）。

新冠病毒毒株的进化树（图片来自论文）进一步证实了两种亚型之间的差异。

SARS-CoV 家族中的其他较古老的病毒具有序列 S84L。

因此，研究认为目前流行的L亚型是由S亚型进化而来，而S亚型实际上是L亚型的“祖先”。

值得注意的是，研究分析认为这两个亚型并未发生自然循环重组； SNP分析进一步证实了这一谱系分类，72个病毒序列为T4，编码L； 29个病毒序列为C4，编码S。

L型为T碱基（对应亮氨酸，Leu），S型为C碱基（对应丝氨酸，Ser）。

通过与其他冠状病毒比较，作者发现S亚型新冠病毒在进化树上更接近蝙蝠来源的冠状病毒，从而得出S亚型相对更古老的结论。

武汉疫情初期L亚型较为流行，1月初后L亚型出现频率下降。

作者认为，人为干预可能对 L 亚型施加了更大的选择压力，如果没有这些干预，L 亚型可能更具攻击性并且传播得更快。

另一方面，由于选择压力相对较弱，进化上较老且攻击性较小的S型可能相对频率有所增加。

一个自然的推论是，相对古老的S型冠状病毒应该产生更多的毒株，因为它有更多的时间在人群中传播。

然而，基因组数据表明，70%为L型，30%为S型，且每个L型菌株比S型菌株携带相对更多的新生突变。

为什么相对年轻的L型冠状病毒会产生更多毒株？作者推测，L型病毒在人体内的传播性更强或复制速度更快，这可能意味着它的毒性也更强。

两种新冠病毒亚型的时间和空间分布存在差异（图片来源论文）。

作者随后对比了1月7日前后S型和L型比例的变化，发现病毒株中L型比例下降，而S型比例上升。

对于这种有些反常的变化，作者也给出了自己的假设——因为中国采取了强有力的防疫措施，L型病毒患者可能更容易出现症状，从而更容易受到人工干预，从而使L型病毒成为可能。