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管轶的新证据再次指向穿山甲!与新冠病毒的氨基酸相似度达到97.4%

发布于:2024-06-18 编辑:匿名 来源:网络

这并不是第一次新冠病毒的潜在中间宿主指向穿山甲! 2020年2月7日,华南农业大学召开新型冠状病毒肺炎疫情科研攻关新闻发布会。

华南农业大学和岭南现代农业科技广东省实验室的研究人员教授·沈永义和肖立华在会上表示,穿山甲可能是COVID-19的潜在中间宿主。

最近病毒学家总统管轶领导的研究成为穿山甲是中间宿主的又一有力证据。

2018年2月18日,香港大学管轶团队与广西医科大学胡艳玲团队合作的题为《中国南方马来亚穿山甲中 Ncov 相关冠状病毒的鉴定》(中国南方马来亚穿山甲中nCoV相关冠状病毒的鉴定)在预印本网站bioRxiv上发表。

【图片来源:bioRxiv 作者:bioRxiv】三批穿山甲样本的分析研究 事实上,在所有哺乳动物中,穿山甲被非法贩运的数量是最高的。

它们既可用作食物来源,也可用于传统中药。

许多穿山甲物种现在在世界自然保护联盟濒危物种红色名录中被视为极度濒危。

于是管轶的团队开始从走私的穿山甲身上进行调查。

具体来说,研究团队对三批穿山甲样品进行了分析研究(样品中还包含穿山甲“药材”)。

首先,研究小组从广西海关2018年8月至2018年1月缉私行动中查获的18只冷冻穿山甲中采集了43份组织样本(肺、肠、血液)。

RNA高通量测序显示,43份样本中有6份存在冠状病毒:肺中 2 个,肠中 2 个,肺肠混合物中 1 个,血液中 1 个。

据报道,利用混合的肠肺样本,利用 Vero-E6 细胞系能够分离出一种新的 β 冠状病毒属。

同时,利用序列读取数据并通过扩增子测序填补空白,团队在系统发育分析中获得了6条完整或接近完整的基因组序列——记为GX/P1E、GX/P2V、GX/P3B、GX/P4L、GX/P5E 、和 GX/P5L——它们属于 Ncov 谱系(图 A)。

这些病毒具有与 Ncov 相似的基因组组织,具有九个预测的开放阅读框(图 B)。

随后,研究团队对今年5月至7月的一批穿山甲样本进行了进一步的qPCR检测,发现12只穿山甲的19个样本(9个肠组织、10个肺组织)中,3个肺组织样本呈冠状病毒阳性。

因此,两批穿山甲样本中的冠状病毒是一致的。

最后,管轶团队联系了广州海关技术中心,该中心对2018年3月缉私行动中查获的5份存档穿山甲样本(包括2份皮拭子、1份不明组织和1份鳞片)进行了重新检测。

样品中发现。

样本中的冠状病毒属于新型冠状病毒的两个亚型。

据此,研究团队生成了占病毒全长基因组86.3%的部分基因组序列,随后发现:穿山甲样本中发现的冠状病毒基因组与这种新型冠状病毒不同。

冠状病毒(SARS-CoV-2)的基因组相似率为85.5%-92.4%。

它属于新型冠状病毒的两个亚型。

其中一个受体结合域(GD/P1L和GD/P2S)与新型冠状病毒密切相关。

雷锋网获悉,新型冠状病毒属于β冠状病毒属的Sarbecovirus亚属,而Sarbecovirus亚属的早期冠状病毒成员已经经历了广泛的基因重组。

管轶团队进一步分析表明,蝙蝠冠状病毒ZC45和ZCS21含有多个SARS-CoV相关谱系(基因组区2、5、7)和新冠病毒相关谱系(包括此次在穿山甲中发现的病毒谱系)的基因组片段。

(区域 1、3、4、6、8)。

更重要的是,该团队观察到了穿山甲冠状病毒、蝙蝠冠状病毒RaTG13和新型冠状病毒之间的假定重组信号。

特别是,新型冠状病毒与广东穿山甲冠状病毒受体结合域的氨基酸序列相似度高达97.4%。

尽管新冠病毒在病毒基因组的其余部分与蝙蝠冠状病毒关系最为密切,但蝙蝠冠状病毒RaTG与其受体结合域的氨基酸相似度仅为89.2%。

同时,在共享氨基酸方面,广东穿山甲冠状病毒与新型冠状病毒在病毒受体区域的5个关键残基上有共享氨基酸(如下图红框所示),而蝙蝠冠状病毒仅在与新型冠状病毒共有一种氨基酸。

此外,系统发育分析显示,广东穿山甲冠状病毒并不是新型冠状病毒的近亲。

因此,虽然目前还不能得出明确的结论,但研究团队推测,广东穿山甲冠状病毒与新型冠状病毒的氨基酸相似性可能是由于趋同进化而非重组所致。

这也进一步证明了中间动物宿主对于人类的重要性。

病毒的出现所起到的作用(这也揭穿了之前的“人造病毒”阴谋论)。

蝙蝠以外唯一感染新冠病毒的哺乳动物 雷锋网获悉,穿山甲是迄今为止除蝙蝠之外唯一感染新冠病毒的哺乳动物。

在穿山甲身上发现了两种冠状病毒谱系,而这两种冠状病毒谱系都与新冠病毒有关,这自然表明穿山甲很可能是新冠病毒的长期宿主。

管轶的新证据再次指向穿山甲!与新冠病毒的氨基酸相似度达到97.4%

但论文还提到了另一种可能性——穿山甲独立于蝙蝠或其他动物宿主而获得与新冠病毒相关的病毒。

这一推论很大程度上与穿山甲的起源有关——上述穿山甲样本大多来自东南亚,穿山甲携带的病毒多样性可以说是神秘莫测。

事实上,正如研究团队所强调的:冠状病毒,包括与 COVID-19 相关的病毒,在亚洲许多野生哺乳动物中都很明显。

因此,需要对穿山甲病毒的流行病学、致病性、种间传染性和传播性进行进一步的研究和调查。

但不可否认的是,这项研究再次为新冠病毒中间宿主的研究指明了方向。

关于管轶 本文的通讯作者之一是管轶。

【雷锋网注:管轶和他的团队,图片来源百度百科】事实上,管轶是医学微生物学专家、英国皇家内科医学院外籍院士、英国皇家内科医学院教授主席(病毒学)香港大学崇光基金会的新发病毒性疾病研究。

教授现任香港大学新发传染病国家重点实验室主任、香港大学流感研究中心主任、汕头大学与香港大学病毒学联合研究所所长孔博士,粤港新发传染病联合实验室主任。

2016年,管轶团队率先分离出SARS病毒,并证实果子狸是SARS的中间宿主,也是人类感染SARS的直接来源。

随后,他和钟南山院士一起汇报,广东开始清理市场上的果子狸,有效遏制了非典。

流行性。

2016年,管轶与李兰娟院士、高福院士、袁国勇、教授等人一起荣获年度国家科技进步奖“以新发传染病为代表的新发传染病防控体系创新与技术突破”人感染H7N9禽流感的预防和控制”。

奖。

2019年疫情肆虐之初(1月15日),管轶在接受采访时表示:冠状病毒最长潜伏期为15天,自1月3日以来,大陆没有新增感染病例,所以我们可以判断疫情。

已经在控制之中了。

从目前情况来看,患者的症状并不严重,即使存在人传人,也非常有限。

传染源明确,疫情得到控制。

我们已经看到了胜利的曙光,相信人们能够度过美好的一年。

不过,管轶在2019年1月23日接受财新采访时表示:保守估计,感染规模最终可能是SARS的10倍。

我经历了这么多,以前从来没有感到害怕,大部分都是可控的,但这次我害怕了。

此声明一出,批评管轶的声音铺天盖地而来——从批评、指责到人身攻击、谩骂。

然而,管轶主导的论文发表,似乎证明:这一次我不怕了。

管轶的新证据再次指向穿山甲!与新冠病毒的氨基酸相似度达到97.4%

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