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IBM超级计算机筛选出77种抗病毒化合物，成为抗击疫情的生力军

发布于：2024-06-18 编辑：匿名来源：网络

在抗击疫情的生死竞赛中，越快越好。

这场抗疫竞赛背后，超级计算机成为加速器。

据 Venture Beat 报道，IBM 已加入美国政府成立的 COVID-19 高性能计算（HPC）联盟，帮助研究人员部署预测模型，分析新冠病毒疫情的发展过程，并加快病毒治疗进度。

当面对病毒（包括 COVID-19 病毒）等新生化合物时，研究人员在实验室中培养微生物，观察它们对引入的新生化合物的反应，逐渐缩小潜在变量的范围。

然而，单个变量可能包含数百万甚至数十亿需要模拟的数据，仅仅依靠研究人员的观察将是一个巨大的挑战。

当前，世界正处于抗击疫情的非常时期。

数据显示，全球COVID-19确诊病例数已超过33万例（截至发稿），海外多国正处于疫情爆发期，确诊病例数持续上升。

在这场抗疫赛跑中，时间是胜负的重要因素。

我们对病毒了解得越多，距离研究疫苗越近，新冠病毒的威胁就越小。

IBM 研究总监 Dario Gil在博客中表示，流行病学、生物信息学和分子建模方面的实验需要大量计算。

如果手动完成，实验将需要数年时间才能完成；如果在较慢的传统计算平台上运行也需要几个月的时间，而超级计算机的高性能计算系统可以快速解决这一计算问题。

雷锋网注：图片来源ExtremeTech 据悉，此次参与COVID-19研究的IBM Summit超级计算机是目前全球最强大的超级计算机。

它由计算服务器组成，每台服务器包含2个22核Power9处理器和6个Nvidia Volta VGPU。

此外，Summit拥有超过10PB的内存，计算能力高达PFlops。

在加入 COVID-19 高性能计算联盟之前，Summit 已经在 COVID-19 研究方面取得了突破。

美国橡树岭国家实验室的研究人员表示，他们的团队利用 Summit 找到了对抗 COVID-19 的最有效的现有药物。

IBM超级计算机筛选出77种抗病毒化合物，成为抗击疫情的生力军

经询问，该研究成果已发表在《ChemRxiv》杂志上，论文标题为《Repurpose Therapeutics for COVID-19: Supercomputer-Based Docking to the SARS-CoV-2 Viral Spike Protein and Viral Spike Protein-Human ACE2 Interface》 ”。

在这项研究中，研究人员从多种化合物入手，并使用 Summit 的算法来寻找可以与蛋白质结合并阻止病毒发挥作用的药物。

初步结果显示，Summit筛选出77种化合物，可以与Spike蛋白结合，阻止病毒表面的分子与人体细胞上的血管紧张素转换酶2（ACE2）受体连接。

值得注意的是，虽然Summit计算可以在病毒研究中发挥作用，但它无法自行设计治疗方法。

其临床分析过程并不理想，医疗机构需要对筛选出的化合物进行评估和测试。

可用于临床试验。

此外，Summit 的辅助研究方法只是为了帮助缓解 COVID-19 症状并提高生存率，而不是疫苗开发。

不过，除了IBM之外，COVID-19高性能计算联盟还包括谷歌、微软、美国能源部、伦斯勒理工学院等公司和学术机构；这些机构的计算能力也被运用在病毒研究上。

亚马逊 AWS 部门启动了一项计划，为研究机构和公司提供技术支持，以推进 COVID-19 在诊断、治疗、疫苗等方面的研究。

同样，微软表示将与科学家合作，通过扩大对 Azure 和高性能计算能力的访问，为抗击 COVID-19 的研究人员提供他们所需的工具。

伦斯勒理工学院在伦斯勒计算创新中心部署了人工智能多处理优化系统计算机（AiMOS），该学院表示正在与研究机构联系，以支持与 COVID-19 相关的研究。

越来越多的力量加入到抗击疫情的竞赛中。

面对新冠病毒这一全人类共同的敌人，在多方共同努力下，抗疫成效最终将呈现“1>2”。

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