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看数据背后,MSRA推出新冠数据分析网站

发布于:2024-06-18 编辑:匿名 来源:网络

疫情再次拉近了我们和科学家的距离。

疫情期间,科研人员的探索和发现成为公众关注的焦点和政策制定的依据。

获取最新的科研信息对于我们建立对新冠疫情更加立体、客观的认识具有关键意义。

近日,微软亚洲研究院(MSRA)推出新冠病毒数据分析网站“COVID Insights”,旨在通过相对全面的疫情数据支持学术研究并向公众科普。

COVID Insights网站基于计算生物学、数据分析等领域的专业知识和研究经验,并使用约翰·霍普金斯大学、美国疾病预防控制中心、GISAID等机构的官方数据。

主要分为感染数据分析、基因组和蛋白质结构和研究趋势三大板块。

比较不同国家或地区的传播动态。

哪些地区疫情发展趋势相似?一些国家的数据有所下降。

他们的做法值得借鉴吗?本质上,“感染数据分析”部分为此类问题提供了答案——通过微软亚洲研究院对COVID-19数据的分析,流行病学参数对特定国家和地区疾病传播动态的影响一目了然。

例如,澳大利亚2019年2月3日至4月26日的疫情传播趋势与冰岛2019年2月1日至4月17日的趋势相似56%。

因此,冰岛可以借鉴澳大利亚的疫情防控措施。

通过移动光标位置,将时间限定为3月22日至4月15日,可以发现澳大利亚这段时间的传播趋势与韩国2月29日至3月17日的传播趋势有80%的相似度。

因此,澳大利亚可以参考韩国今年3月中下旬的防控措施。

众所周知,目前美国的COVID-19确诊病例已逼近1万例。

看数据背后,MSRA推出新冠数据分析网站

如果我们使用这个功能,我们可以看到3月20日到4月26日期间美国疫情的发展趋势和发展趋势(目前这个功能的数据只更新到4月26日)。

伊朗两周前就有了75%的相似度,所以此时参考对方的措施是一个可行的解决方案。

雷锋网获悉,该功能的数据集来自约翰·霍普金斯大学系统科学与工程中心发布的新冠疫情数据。

SARS-CoV-2的病毒学分析结果 与上述部分相比,“基因组和蛋白质结构”部分更加抽象。

本节展示了SARS-CoV-2(新型冠状病毒)的病毒学分析结果,主要关注SARS-CoV-2病毒本身,主要包括以下两个功能:第一,基因组和蛋白质结构。

不久前,外媒“新型冠状病毒来自武汉”的说法引起轩然大波。

事实上,早在2020年2月20日,中国科学院西双版纳热带植物园就发布研究成果,称武汉华南海鲜市场的新冠病毒是从外地传入的,因此“外源”新冠病毒的“理论”出现了。

”。

在这项研究中,有一个非常复杂的图景,实际上反映了病毒基因组突变的问题。

事实上,在病毒基因组变异方面,现在世界各地都有大量的研究数据。

网站称,微软亚洲研究院从全球流感序列数据库GISAID下载了SARS-CoV-2基因组数据,并以病毒株Wuhan-Hu-1为参考序列,确定了其中突变的氨基酸和位置。

每个病毒序列。

因此,通过在下拉列表中选择一个大陆,我们可以直观地看到特定核酸片段上发生突变的氨基酸的数量、区域分布和突变时间线。

同时,网站上的SARS-CoV-2病毒核酸序列转换得到的三维蛋白质结构也为相关研究提供了参考。

其次,与其他冠状病毒的比较。

据了解,目前在全球肆虐的SARS-CoV-2病毒是已知的第七种可以感染人类的??冠状病毒。

其余六种包括我们可能不再熟悉的SARS-CoV(引起SARS的病毒)。

病毒)和中东呼吸综合征冠状病毒(引起中东呼吸综合征的病毒)。

除了将 SARS-COV-2 与 SARS-COV 和 MERS-COV 进行比较外,COVID Insights 网站上还对 SARS-COV 与其他两种病毒进行了比较。

值得一提的是,蝙蝠-冠状病毒和穿山甲-冠状病毒这两种病毒来自中华菊头蝠和巽他穿山甲,它们此前是新冠病毒潜在中间宿主的热门候选者。

根据 COVID Insights 网站显示,Bat-CoV、Pangolin-CoV、SARS-CoV、MERS-CoV 和 SARS-CoV-2 之间的相似度按降序排列,分别为 96%、90%、79% 和 49%。

全球COVID-19研究趋势2020年1月1日至4月22日,多个领域的研究人员进行了大量研究。

微软亚洲研究院对开放获取的论文数据库COVID-19 Open Research Dataset进行统计和整合数据,并根据不同时间段(按周统计),在流行病学、社会科学、病毒学四个领域做出了报告和诊断。

冠状病毒研究趋势词云。

因此,我们可以发现,2月26日至3月4日这一周,“传播”一词在流行病学研究中出现的频率更高。

4月8日至4月15日这一周,“数字”一词成为社会科学研究的关键词。

值得一提的是,COVID Insights网站还列出了流行病学、社会科学、病毒学和诊断学四个领域的高被引论文。

这样,公众也在一定程度上减少了低质量论文的影响。

论文存在误导性的风险。

事实上,近一段时间,与疫情相关的学术论文呈现激增态势,低质量研究论文泛滥现象也相当严重。

2020年4月23日,卡内基梅隆大学伦理与政策中心主任Alex John London和麦吉尔大学生物医学伦理学系教授兼主任Jonathan Kimmelman也在《科学》杂志上发表文章,发出呼吁:不应以COVID-19疫情的紧迫性为借口,降低病毒研究和疫苗研发的科研标准。

可以看到,虽然目前COVID Insights网站的数据还不是特别全面,但对于加速优质科研信息的交流和共享确实发挥了重要作用。

正如比尔·盖茨所说:这次疫情是现代社会第一次真正的大流行。

这就像一场世界大战,只不过这次我们都站在同一边。

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